مواد ضد عفونی کننده و شوینده ها جهت ضد عفونی کردن محیط دهان و ابزارها و هم چنین برای جلوگیری از عفونت می باشد. از این نوع مواد مصرفی دندانپزشکی می توان به موارد زیر اشاره کرد :
- ضدعفونی کننده های دهانی: مانند کلرهگزیدین که برای شستشوی دهان و جلوگیری از عفونت به کار می رود.
- شوینده های دندانپزشکی: هیپوکلریت سدیم که مخصوص تمیز کردن کانال های ریشه در درمان های اندودنتیک می باشد.